SNP主要指在基因組水平上,由于單個核苷酸變異引起的DNA序列多態性。其在生物基因組中分布廣泛、數目多且相對穩定,是物種中不同個體表型變異的主要遺傳來源。而且SNP標記技術易于自動化、高通量的檢測分析,所以使SNP成為繼第一代分子標記技術RFLP與第二代分子標記技術STR多態標記后的第三代分子標記技術。由生物基因組中SNP的密度是最高的,是構建生物高通量基因分型最適合的標記,但是由于SNP是單核苷酸變異產生的多態性,所以不能使用常規的PCR技術與凝膠電泳技術來區分其多態性。而使用測序技術來分析SNP位點,這樣雖然標記密度高,但是成本也相對很高,而且很耗時。所以,競爭性等位基因特異PCR(Kompetitive Allele Specific PCR ,KASP)因其經濟靈活的特點,作為國際上主流SNP檢測方法之一,替代傳統的高通量測序,在SNP分型研究中發揮重要作用。
1. KassaSemagn et al. (2013) Single nucleotide polymorphism genotyping using Kompetitive Allele Specifi c PCR (KaSp): overview of the technology and its application in crop improvement. Molecular Breeding.